MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1

Total Repeats: 107799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012796	CGT	2	6	265	270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904640
2	NC_012796	CGT	2	6	275	280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904640
3	NC_012796	CGC	2	6	299	304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904640
4	NC_012796	GCC	2	6	348	353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904640
5	NC_012796	GC	3	6	398	403	0 %	0 %	50 %	50 %	239904640
6	NC_012796	CGC	3	9	401	409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904640
7	NC_012796	GCC	2	6	420	425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904640
8	NC_012796	CGC	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904640
9	NC_012796	A	7	7	493	499	100 %	0 %	0 %	0 %	239904640
10	NC_012796	CTGGCC	2	12	510	521	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239904640
11	NC_012796	GCG	2	6	538	543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904640
12	NC_012796	TGC	2	6	601	606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904640
13	NC_012796	AGCC	2	8	633	640	25 %	0 %	25 %	50 %	239904640
14	NC_012796	CGCC	2	8	695	702	0 %	0 %	25 %	75 %	239904640
15	NC_012796	ACG	2	6	826	831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904640
16	NC_012796	GCC	2	6	835	840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904640
17	NC_012796	GCC	2	6	867	872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904640
18	NC_012796	GGCC	2	8	1028	1035	0 %	0 %	50 %	50 %	239904640
19	NC_012796	CGC	2	6	1050	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904640
20	NC_012796	AAG	2	6	1155	1160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239904640
21	NC_012796	CCCGG	2	10	1217	1226	0 %	0 %	40 %	60 %	239904640
22	NC_012796	GGC	2	6	1274	1279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904640
23	NC_012796	GGC	2	6	1338	1343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904640
24	NC_012796	CAA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239904640
25	NC_012796	TGC	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904640
26	NC_012796	GCC	2	6	1444	1449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904640
27	NC_012796	CAT	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904641
28	NC_012796	CAT	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904641
29	NC_012796	GGC	2	6	1941	1946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904641
30	NC_012796	CGC	2	6	2004	2009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904641
31	NC_012796	AGG	2	6	2021	2026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239904641
32	NC_012796	GCG	2	6	2033	2038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904641
33	NC_012796	C	6	6	2076	2081	0 %	0 %	0 %	100 %	239904641
34	NC_012796	TCA	2	6	2126	2131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904641
35	NC_012796	GCC	2	6	2191	2196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904641
36	NC_012796	TCC	2	6	2234	2239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239904641
37	NC_012796	ATC	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904641
38	NC_012796	CCGC	2	8	2330	2337	0 %	0 %	25 %	75 %	239904641
39	NC_012796	CCA	2	6	2361	2366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239904641
40	NC_012796	ACG	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904641
41	NC_012796	TGC	2	6	2408	2413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904641
42	NC_012796	CAC	2	6	2520	2525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239904641
43	NC_012796	TGA	2	6	2532	2537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239904641
44	NC_012796	ACA	2	6	2714	2719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239904641
45	NC_012796	CGGGC	2	10	2745	2754	0 %	0 %	60 %	40 %	239904641
46	NC_012796	GCCAGG	2	12	2771	2782	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239904641
47	NC_012796	CGA	2	6	2849	2854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904641
48	NC_012796	GAC	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904641
49	NC_012796	TCA	3	9	2966	2974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904641
50	NC_012796	TAT	2	6	3001	3006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239904641
51	NC_012796	ACG	2	6	3052	3057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904642
52	NC_012796	TGGC	2	8	3190	3197	0 %	25 %	50 %	25 %	239904642
53	NC_012796	AAGG	2	8	3288	3295	50 %	0 %	50 %	0 %	239904642
54	NC_012796	CCGG	2	8	3296	3303	0 %	0 %	50 %	50 %	239904642
55	NC_012796	CGG	2	6	3335	3340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904642
56	NC_012796	ACG	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904642
57	NC_012796	CGG	2	6	3371	3376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904642
58	NC_012796	GGT	2	6	3398	3403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239904642
59	NC_012796	AAG	2	6	3450	3455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239904642
60	NC_012796	GCGCG	2	10	3473	3482	0 %	0 %	60 %	40 %	239904642
61	NC_012796	CAC	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239904642
62	NC_012796	CGA	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904642
63	NC_012796	CCAG	2	8	3568	3575	25 %	0 %	25 %	50 %	239904642
64	NC_012796	AGCTGG	2	12	3631	3642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	239904642
65	NC_012796	CGA	2	6	3650	3655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904642
66	NC_012796	CGG	2	6	3689	3694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904642
67	NC_012796	ATC	2	6	3747	3752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904642
68	NC_012796	CAT	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904642
69	NC_012796	GAA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239904642
70	NC_012796	CAA	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239904642
71	NC_012796	GGC	2	6	3861	3866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904642
72	NC_012796	GAC	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904642
73	NC_012796	CCG	2	6	3988	3993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904642
74	NC_012796	CCCCAG	2	12	4011	4022	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	239904642
75	NC_012796	AGACCA	2	12	4033	4044	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	239904642
76	NC_012796	TGG	2	6	4072	4077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239904642
77	NC_012796	GGCCCG	2	12	4163	4174	0 %	0 %	50 %	50 %	239904642
78	NC_012796	GCC	2	6	4179	4184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904642
79	NC_012796	TCG	2	6	4294	4299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904642
80	NC_012796	CGGC	2	8	4309	4316	0 %	0 %	50 %	50 %	239904642
81	NC_012796	CAA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239904642
82	NC_012796	TCA	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904642
83	NC_012796	CGA	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904642
84	NC_012796	GAG	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239904642
85	NC_012796	TCA	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904642
86	NC_012796	CCGACG	2	12	4543	4554	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239904642
87	NC_012796	GCC	2	6	4646	4651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904642
88	NC_012796	TCA	2	6	4687	4692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904642
89	NC_012796	GAC	2	6	4695	4700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904642
90	NC_012796	GAC	2	6	4763	4768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904642
91	NC_012796	GAG	2	6	4857	4862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239904642
92	NC_012796	CTG	2	6	4863	4868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904642
93	NC_012796	GCC	2	6	4896	4901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904642
94	NC_012796	GAG	2	6	4983	4988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239904642
95	NC_012796	CCG	2	6	5081	5086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904642
96	NC_012796	CGG	2	6	5171	5176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904642
97	NC_012796	GAC	2	6	5205	5210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904642
98	NC_012796	TCC	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239904642
99	NC_012796	AAG	2	6	5492	5497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239904643
100	NC_012796	TCA	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904643
101	NC_012796	CCGC	2	8	5637	5644	0 %	0 %	25 %	75 %	239904643
102	NC_012796	GTC	2	6	5645	5650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904643
103	NC_012796	ACG	2	6	5697	5702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
104	NC_012796	CGC	2	6	5785	5790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904643
105	NC_012796	GGC	2	6	5791	5796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904643
106	NC_012796	ACA	2	6	5889	5894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239904643
107	NC_012796	GCCG	2	8	5905	5912	0 %	0 %	50 %	50 %	239904643
108	NC_012796	CCA	2	6	5919	5924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239904643
109	NC_012796	CTC	2	6	5950	5955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239904643
110	NC_012796	CCA	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239904643
111	NC_012796	CTG	2	6	6020	6025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904643
112	NC_012796	CCT	2	6	6042	6047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239904643
113	NC_012796	CAT	2	6	6061	6066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904643
114	NC_012796	CGG	2	6	6112	6117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904643
115	NC_012796	ACC	2	6	6140	6145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239904643
116	NC_012796	GGGCC	2	10	6169	6178	0 %	0 %	60 %	40 %	239904643
117	NC_012796	AAGA	2	8	6194	6201	75 %	0 %	25 %	0 %	239904643
118	NC_012796	CAA	2	6	6241	6246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239904643
119	NC_012796	TGG	2	6	6255	6260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239904643
120	NC_012796	ACG	2	6	6282	6287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
121	NC_012796	CGA	2	6	6316	6321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
122	NC_012796	TCA	2	6	6384	6389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904643
123	NC_012796	CGC	2	6	6408	6413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904643
124	NC_012796	CCGG	2	8	6457	6464	0 %	0 %	50 %	50 %	239904643
125	NC_012796	CACC	2	8	6502	6509	25 %	0 %	0 %	75 %	239904643
126	NC_012796	GAG	2	6	6557	6562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239904643
127	NC_012796	ACA	2	6	6600	6605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239904643
128	NC_012796	CGA	2	6	6607	6612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
129	NC_012796	CAT	2	6	6622	6627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904643
130	NC_012796	CCAGGC	2	12	6694	6705	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239904643
131	NC_012796	CGA	2	6	6760	6765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
132	NC_012796	TCA	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904643
133	NC_012796	ACG	2	6	6816	6821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
134	NC_012796	TGC	2	6	6825	6830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904643
135	NC_012796	GCG	2	6	6831	6836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904643
136	NC_012796	CGA	2	6	6844	6849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
137	NC_012796	GGA	2	6	6901	6906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239904643
138	NC_012796	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
139	NC_012796	TCA	2	6	6954	6959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904643
140	NC_012796	CAA	2	6	7010	7015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239904643
141	NC_012796	GCG	2	6	7020	7025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904643
142	NC_012796	CGGC	2	8	7050	7057	0 %	0 %	50 %	50 %	239904643
143	NC_012796	GAC	2	6	7058	7063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
144	NC_012796	CCA	3	9	7083	7091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239904643
145	NC_012796	ACC	2	6	7092	7097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239904643
146	NC_012796	GTT	2	6	7102	7107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239904643
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148	NC_012796	GC	3	6	7182	7187	0 %	0 %	50 %	50 %	239904643
149	NC_012796	CTG	2	6	7199	7204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904643
150	NC_012796	GAG	2	6	7259	7264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239904643
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152	NC_012796	ACG	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
153	NC_012796	CGA	3	9	7399	7407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
154	NC_012796	CAG	2	6	7430	7435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
155	NC_012796	GCG	2	6	7461	7466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904643
156	NC_012796	CCGG	2	8	7476	7483	0 %	0 %	50 %	50 %	239904643
157	NC_012796	CGGC	2	8	7488	7495	0 %	0 %	50 %	50 %	239904643
158	NC_012796	GCC	2	6	7532	7537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904643
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161	NC_012796	TCA	2	6	7653	7658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904643
162	NC_012796	GGTCA	2	10	7682	7691	20 %	20 %	40 %	20 %	239904643
163	NC_012796	CGA	4	12	7711	7722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904643
164	NC_012796	CTG	3	9	7724	7732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904643
165	NC_012796	CAA	2	6	7744	7749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239904643
166	NC_012796	ATC	2	6	7751	7756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904643
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247	NC_012796	CCGGC	2	10	11589	11598	0 %	0 %	40 %	60 %	239904647
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250	NC_012796	C	7	7	11643	11649	0 %	0 %	0 %	100 %	239904647
251	NC_012796	TCC	2	6	11726	11731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239904648
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257	NC_012796	GCG	2	6	11922	11927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904648
258	NC_012796	GGT	3	9	11961	11969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239904648
259	NC_012796	GCC	2	6	11995	12000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904648
260	NC_012796	ACC	2	6	12055	12060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239904648
261	NC_012796	GGC	2	6	12088	12093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904648
262	NC_012796	CTG	2	6	12145	12150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904648
263	NC_012796	GCC	2	6	12211	12216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904648
264	NC_012796	GTG	2	6	12250	12255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239904648
265	NC_012796	GCG	2	6	12305	12310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239904648
266	NC_012796	GCT	2	6	12390	12395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904648
267	NC_012796	GCT	2	6	12402	12407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904648
268	NC_012796	TGCTTC	2	12	12428	12439	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239904648
269	NC_012796	ACC	2	6	12469	12474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239904648
270	NC_012796	TGC	2	6	12485	12490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904648
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274	NC_012796	CGC	2	6	12555	12560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904648
275	NC_012796	GCTGTT	2	12	12564	12575	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	239904648
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278	NC_012796	TGC	2	6	12671	12676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904648
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282	NC_012796	GTC	2	6	12952	12957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904648
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286	NC_012796	TTC	2	6	13148	13153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239904649
287	NC_012796	CTG	2	6	13174	13179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904649
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290	NC_012796	TCA	2	6	13349	13354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904649
291	NC_012796	ACC	2	6	13471	13476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239904649
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293	NC_012796	CGA	2	6	13506	13511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904649
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337	NC_012796	CTG	2	6	15885	15890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239904652
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369	NC_012796	CCG	2	6	17480	17485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904654
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373	NC_012796	CGAGGC	2	12	17574	17585	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239904654
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375	NC_012796	ACC	2	6	17737	17742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239904654
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378	NC_012796	CT	3	6	17821	17826	0 %	50 %	0 %	50 %	239904654
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380	NC_012796	GCC	3	9	17892	17900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904655
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382	NC_012796	CGC	2	6	18068	18073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239904655
383	NC_012796	CGA	3	9	18110	18118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239904655
384	NC_012796	GCCG	2	8	18120	18127	0 %	0 %	50 %	50 %	239904655
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386	NC_012796	ATC	2	6	18213	18218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239904655
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